Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vsig2Q9Z109 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsig2Q9Z109 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsig2Q9Z109 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms