Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Clip2Q9Z0H8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip2Q9Z0H8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clip2Q9Z0H8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms