Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms