Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katna1Q9WV86 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katna1Q9WV86 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katna1Q9WV86 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms