Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArcQ9WV31 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArcQ9WV31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ArcQ9WV31 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ArcQ9WV31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms