Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClcnkbQ9WUB6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClcnkbQ9WUB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms