Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn8aQ9WTU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn8aQ9WTU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms