Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfwd2Q9R1A8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfwd2Q9R1A8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd2Q9R1A8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms