Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntn3Q9R1A3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ntn3Q9R1A3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntn3Q9R1A3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms