Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc26a4Q9R155 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc26a4Q9R155 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms