Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1bp2Q9R000 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb1bp2Q9R000 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb1bp2Q9R000 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms