Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf4Q9QZS2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf4Q9QZS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms