Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms