Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk3Q9QZL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk3Q9QZL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk3Q9QZL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk3Q9QZL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms