Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clic4Q9QYB1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clic4Q9QYB1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clic4Q9QYB1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clic4Q9QYB1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms