Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxe3Q9QY14 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Foxe3Q9QY14 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxe3Q9QY14 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms