Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip4Q9QXN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip4Q9QXN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trip4Q9QXN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip4Q9QXN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms