Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf3Q9QXK7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms