Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sall2Q9QX96 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sall2Q9QX96 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall2Q9QX96 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall2Q9QX96 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms