Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csnk1eQ9JMK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms