Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms