Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms