Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem3Q9JKE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms