Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scamp5Q9JKD3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scamp5Q9JKD3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scamp5Q9JKD3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms