Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ybx3Q9JKB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ybx3Q9JKB3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ybx3Q9JKB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ybx3Q9JKB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms