Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd3Q9JJY3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd3Q9JJY3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd3Q9JJY3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms