Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem47Q9JJG6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem47Q9JJG6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem47Q9JJG6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem47Q9JJG6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem47Q9JJG6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms