Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ5

Tfap4, Activator protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap4Q9JIZ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap4Q9JIZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfap4Q9JIZ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfap4Q9JIZ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap4Q9JIZ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms