Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad9Q9JIW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms