Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ercc6l2Q9JIM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6l2Q9JIM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ercc6l2Q9JIM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms