Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn12Q9ET43 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn12Q9ET43 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms