Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESZ8

Gtf2i, General transcription factor II-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2iQ9ESZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2iQ9ESZ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2iQ9ESZ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2iQ9ESZ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2iQ9ESZ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2iQ9ESZ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2iQ9ESZ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2iQ9ESZ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms