Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dkc1Q9ESX5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dkc1Q9ESX5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms