Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Oxct2bQ9ESL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oxct2bQ9ESL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Oxct2bQ9ESL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Oxct2bQ9ESL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms