Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rb1cc1Q9ESK9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rb1cc1Q9ESK9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms