Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tor1bQ9ER41 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor1bQ9ER41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor1bQ9ER41 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms