Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpcn1Q9EQJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpcn1Q9EQJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpcn1Q9EQJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpcn1Q9EQJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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