Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndst3Q9EQH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndst3Q9EQH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndst3Q9EQH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ndst3Q9EQH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ndst3Q9EQH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ndst3Q9EQH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ndst3Q9EQH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ndst3Q9EQH7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ndst3Q9EQH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ndst3Q9EQH7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ndst3Q9EQH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndst3Q9EQH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Ndst3Q9EQH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Ndst3Q9EQH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ndst3Q9EQH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ndst3Q9EQH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ndst3Q9EQH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndst3Q9EQH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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