Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAA3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAA3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9DAA3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms