Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms