Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdzd9Q9D9M4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdzd9Q9D9M4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzd9Q9D9M4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdzd9Q9D9M4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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