Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Speer4bQ9D9F7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Speer4bQ9D9F7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4bQ9D9F7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Speer4bQ9D9F7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms