Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TcimQ9D915 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TcimQ9D915 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TcimQ9D915 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TcimQ9D915 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms