Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SlirpQ9D8T7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SlirpQ9D8T7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SlirpQ9D8T7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms