Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tvp23bQ9D8T4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tvp23bQ9D8T4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tvp23bQ9D8T4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms