Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms