Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifi35Q9D8C4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi35Q9D8C4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ifi35Q9D8C4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi35Q9D8C4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi35Q9D8C4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi35Q9D8C4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms