Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chmp5Q9D7S9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp5Q9D7S9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms