Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgm5Q9D7I9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgm5Q9D7I9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgm5Q9D7I9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm5Q9D7I9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tgm5Q9D7I9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms