Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D727 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D727 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D727 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D727 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D727 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D727 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D727 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D727 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D727 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D727 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D727 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D727 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D727 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D727 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D727 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D727 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D727 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D727 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D727 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D727 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D727 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D727 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D727 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D727 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D727 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D727 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D727 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D727 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D727 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D727 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D727 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D727 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D727 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D727 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D727 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms